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RNA干扰机理 RNA干扰是由长链型、完全型或不完全型双链RNA激活的,这些双链RNA被识别并被一种叫做“Dicer”(切割器)或者“DCL” (切割器形) 的RNA酶III进行特异性剪切,得到21–26个核苷酸的小型双链。然后这些小型双链RNA以单链RNA的形式被识别、解链和重组为RISC (RNA诱导沉默蛋白复合体),在此他们直接由Argonaute 家族的蛋白质通过序列互补、剪切或翻译表达为靶标信使RNA。第一,微小RNA 起源于明显不同于其他识别基因的基因位点,而小型干扰RNA通常起源于信使RNA、转座子、病毒 或异染色质的 DNA。第二,微小RNA由能形成局部RNA 发夹结构的转录体加工而成,而小型干扰RNA 由长链双分子RNA双链体或拓展发夹结构加工而成。 再次, 单个“微小RNA:微小RNA”双链体起源于每个微小RNA发夹结构的前体分子, 而小型干扰RNA 双链体集合体起源于每个小型干扰RNA前体分子,导致了许多不同的小型干扰RNA在这种拓展型的双链RNA的双链上聚合。 第四,相关生物中的微小RNA序列几乎总是保守的,而外源小型干扰RNA 序列很少是保守。 第五,关于微小RNA 和外源小型干扰RNA的生物靶标方面,外源小型干扰RNA是典型的 “自动沉默”,也就是它们在其起源的同一位点(或非常相似的位点)沉默,而微小RNA 是“异位沉默”,也就是它们是由具备非常不同的沉默的基因产生的。重点词汇掌握:RNA :脱氧核糖核酸RNAi全称:RNA interference,翻译成“RNA干扰”dsRNAs全称:Double-stranded RNAs,翻译成“双链RNA”miRNA:微小RNAsiRNA:小型干扰RNA
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Ⅲ家族中对双链RNA具有特异性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成员,激发与之互补的目标mRNA的沉默。siRNA原理: RNA干涉(RNAi)在实验室中是一种强大的实验工具,利用具有同源性的双链RNA(dsRNA)诱导序列特异的目标基因的沉寂,迅速阻断基因活性。siRNA在RNA沉寂通道中起中心作用,是对特定信使RNA(mRNA)进行降解的指导要素。siRNA是RNAi途径中的中间产物,是RNAi发挥效应所必需的因子。siRNA的形成主要由Dicer和Rde-1调控完成。由于RNA 病毒入侵、转座子转录、基因组中反向重复序列转录等原因,细胞中出现了dsRNA,Rde-1(RNAi缺陷基因-1)编码的蛋白质识别外源dsRNA,当dsRNA达到一定量的时候,Rde-1引导dsRNA与Rde-1编码的Dicer(Dicer是一种RNaseIII 活性核酸内切酶,具有四个结构域:Argonaute家族的PAZ结构域,III型RNA酶活性区域,dsRNA结合区域以及DEAH/DEXHRNA解旋酶活性区)结合,形成酶-dsRNA复合体。在Dicer酶的作用下,细胞中的单链靶mRNA(与dsRNA具有同源序列)与dsRNA的正义链互换,原来dsRNA中的正义链被mRNA代替而从酶-dsRNA复合物中释放出来,然后,在ATP的参与下,细胞中存在的一种RNA诱导的沉默复合体RNA-induced silencing complex (RISC,由核酸内切酶、核酸外切酶、解旋酶等构成,作用是对靶mRNA进行识别和切割)利用结合在其上的核酸内切酶的活性来切割dsRNA上处于原来正义链位置的靶mRNA分子中与dsRNA反义链互补的区域,形成21-23nt的dsRNA小片段,这些小片段即为siRNA。RNAi干涉的关键步骤是组装RISC和合成介导特异性反应的siRNA蛋白。siRNA并入RISC中,然后与靶标基因编码区或UTR区完全配对,降解靶标基因,因此说siRNA只降解与其序列互补配对的mRNA。其调控的机制是通过互补配对而沉默相应靶位基因的表达,所以是一种典型的负调控机制。siRNA识别靶序列是有高度特异性的,因为降解首先在相对于siRNA来说的中央位置发生,所以这些中央的碱基位点就显得极为重要,一旦发生错配就会严重抑制RNAi的效应。 siRNA有如下特点: 1. 长度约在22nt左右。2. 依赖Dicer酶的加工,是Dicer的产物,所以具有Dicer产物的特点。 3. 生成需要Argonaute家族蛋白存在。 4. 是RISC组分。 5. siRNA合成是由双链的RNA或RNA前体形成的。6. siRNA是人工体外合成的,通过转染进入人体内,是RNA干涉的中间产物。 7. 结构上, siRNA是双链RNA。 8. 在Dicer酶的加工过程中, siRNA对称地来源于双链RNA的前体的两侧臂。 9. 在作用位置上, siRNA可作用于mRNA的任何部位。 10. 在作用方式上, siRNA只能导致靶标基因的降解,即为转录水平后调控。11.
Shenyangman。
siRNA指的是小干扰RNA。
小干扰RNA有时称为短干扰RNA或沉默RN,是一个长20到25个核苷酸的双股RNA,在生物学上有许多不同的用途。
已知siRNA主要参与RNA干扰现象,以带有专一性的方式调节基因的表达。此外,也参与一些与RNAi相关的反应途径。
扩展资料:
siRNA具有明确定义的结构,具有磷酸化5'末端的短双链RNA和具有两个突出核苷酸的羟基化3'末端。该切酶酶催化生产的siRNA由长的dsRNA和小发夹RNA。
由于原则上任何基因都可以被具有互补序列的合成siRNA敲低,因此siRNA是在后基因组时代验证基因功能和药物靶向的重要工具。
参考资料来源:百度百科—siRNA