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梦想空间小编
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爱吃糖z

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​ 细胞内细胞器随机运输到溶酶体降解。 ​ 营养不足;基础自噬(营养丰富)

​ 对降解的底物蛋白具有专一性,包括线粒体自噬(mitophagy)、过氧化物酶体自噬(pexophagy)、内质网自噬(reticulophagy)、核糖体自噬(ribophagy)、病原体自噬(xenophagy,针对入侵的细菌)、针对聚集的蛋白的自噬(aggrephagy)等。 ​ Cargo标记:通常是Ub链,由自噬受体(autophagy receptors,如p62,又称SQSTM1)识别,通过与LC3相互作用,运输到吞噬泡(phagophore,或称隔离膜)内。

下图展示了p62的二聚化与隔离(sequestration)作用。在氧化应激状态下,p62首先通过隔离Keap1,使Nrf2游离出来,随后Nrf2进入细胞和激活下游抗氧化应激元件(ARE),而Keap1与p62形成的复合体随后被运输至自噬体降解。此为Keap1-Nrf2-ARE信号通路激活的一种方式。

A图为非选择性自噬,BCD图为选择性自噬的三个例子。

B图

LC3结合p62介导泛素化蛋白(错误折叠蛋白等)隔离到自噬体,涉及细胞存活、细胞凋亡、抗氧化应激三个机制。

C图

线粒体损伤,膜电位丧失,PINK1积累,Pakin转位到线粒体上,泛素化外膜的蛋白,线粒体自噬。

PINK1、 Pakin突变与帕金森病相关。

D图

细菌侵入,p62、NDP52、OPTN介导自噬隔离。

Mizushima N , Komatsu M . Autophagy: Renovation of Cells and Tissues[J]. Cell, 2011, 147.

Kimmelman AC, White E . Autophagy and Tumor Metabolism [J]. Cell Metabolism, 2017, 25.

Dikic I , Elazar Z . Mechanism and medical implications of mammalian autophagy[J]. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 2018, 19.

Beth L and Guido K. Biological Functions of Autophagy Genes: A Disease Perspective [J]. Cell, 2019, 176

线粒体自噬英文

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黑暗中的精灵88

有做线粒体融合分裂相关蛋白的线粒体的融合是与分裂协同进行的,过程高度保守,需要在多种蛋白质的精确调控下完成.两者一般保持动态平衡,这种平衡对维持线粒体正常的形态、分布和功能十分重要.线粒体融合与分裂间的失衡可产生巨型线粒体,这种过大的线粒体常见于病变的肝细胞、恶性营养不良患者的胰脏细胞和白血病患者骨髓的巨噬细胞中.分裂异常会导致线粒体破碎,而融合异常则会导致线粒体形态延长,两者都会影响线粒体的功能.分裂与融合活动异常的线粒体膜电位通常会降低,并最终经线粒体自噬作用清除.线粒体的分裂在真核细胞内经常发生.为了保证在细胞发生分裂后每个子细胞都能继承母细胞的线粒体,母细胞中的线粒体在一个细胞周期需要至少复制一次.即使是在不再分裂的细胞内,线粒体为了填补已老化的线粒体造成的空缺也需要进行分裂.的线粒体以与细菌的无丝分裂类似的方式进行增殖,可细分为三种模式:间壁分离(见于部分动物和植物线粒体):线粒体内部首先由内膜形成隔,随后外膜的一部分内陷,插入到隔的双层膜之间,将线粒体一分为二.收缩分离(见于蕨类植物和酵母菌线粒体):线粒体中部先缢缩同时向两端不断拉长然后一分为二.出芽分离(见于藓类植物和酵母菌线粒体):线粒体上先出现小芽,小芽脱落后成长、发育为成熟线粒体.线粒体的融合也是细胞中的基本事件,对线粒体正常功能的发挥具有非常重要的作用.人类细胞需要通过线粒体融合的互补作用来抵抗衰老;酵母细胞线粒体融合发生障碍会引起呼吸链缺陷.线粒体间的融合需在一种分子量约为800kDa的蛋白质复合物——“融合装置”(fision machinery)的介导下进行,该过程可大致分为四个步骤:锚定、外膜融合、内膜融合以及基质内含物融合.

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皖北一只老色

线粒体: [ xiàn lì tǐ ] 1. mitochondria其它相关解释:

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二的一米

基础知识-研究方法-案例 1.基础知识:     分类: 非选择性自噬 -大自噬、小自噬、分子伴侣介导的自噬;                 选择性自噬 -线粒体自噬 (mitophagy)、聚集体自噬 (aggrephagy) 等选择性自噬;    一、 大自噬形成过程 :3步:内质网和高尔基体等形成环状结构,包裹胞内结构形成双层膜囊泡结构, 即自噬体 ;然后自噬体与溶酶体融合;自噬体内蛋白或者细胞器在溶酶体内被溶酶体酶讲解。( 三类标志物 :囊泡形成过程的标志物、溶酶体标志物、自噬底物标志物)               囊泡形成过程的标志物:  (1) Atg12-Atg5复合物---WB检测: Atg12--15 kDa;Atg5--32 kD;复合体--55 kDa ;(2)Atg16L1--Atg12-Atg5- Atg16L1复合物,不过自噬体形成后就离开了; 检测早期自噬体的形成-方法: 进行免疫透射电镜和免疫染色的检测;(3) LC3 参与了自噬体膜的形成,包括相互转化的形式即LC3-I和LC3-II(细胞内新合成的LC3经过加工, 成为胞浆可溶形式的LC3-I, 后者经泛素化加工修饰, 与自噬体膜表面的PE结合, 成为膜结合形式的LC3-II。LC3-II定位于前自噬体和自噬体, 是 自噬体的标志分子 , 随自噬体膜的增多而增加);检测方法--WB :  LC3-I 18 kDa, LC3-II 16 kDa ;(尽管PE偶联形式的LC3-II的分子质量较LC3-I大, 但是其具有强疏水性, 因此在SDS-PAGE中电泳迁移率反而比LC3-I (非PE偶联的LC3) 快,可以通过Western blot比较组间LC3-II水平, 也可通过计算 LC3-II/LC3-I的比值来评价LC3-II水平 , 并推测自噬囊泡数量的多少。) 注意:LC3在含SDS的样品裂解液中易降解, 因此样品经煮沸裂解后应当尽快进行Western blot实验,并避免反复冻融。  (4)Atg9/mAtg9 --Atg蛋白中唯一的跨膜蛋白;哺乳动物细胞的为mAtg9,在形成成熟自噬体后, mAtg9 并未整合进自噬体囊泡上, 而是又游离进入胞浆;用来检测为自噬的发生;(5) Atg6/Beclin1: 用荧光显微镜或透射电镜可检测Beclin1-GFP的点状聚集或斑块作为自噬标志物            溶酶体标志物: 一般为溶酶体膜蛋白:溶酶体相关膜蛋白1 (lysosome-associated membrane protein type 1, LAMP- 1)、LAMP-2和溶酶体整合膜蛋白 (lysosomal integral membrane protein, LIMP-2)--检测方法:可用免疫组化或Western blot的方法检测溶酶体重要膜蛋白的水平, 并与其他自噬相关蛋白结合使用。                                                                                                                                                                                                            自噬底物标志物: p62也被称为SQSTM1, 在多种细胞和组织中 都有表达, 可作为一个货车蛋白参与多种信号转导过程。p62可连接LC3和泛素化的底物, 随后被整合到自噬体中, 并在自噬溶酶体中被降解; 当自噬被激活时自噬体与溶酶体融合, 自噬囊泡中p62等蛋 白或细胞器被溶酶体酶降解 , p62水平降低 ; 当 自噬被抑制 时自噬体积累 , p62水平升高 。因此, 可以用Western blot方法检测p62的水平, 作为自噬能力变化的指征。 二、CMA的标志物: CMA是胞浆内某些蛋白质被分子伴侣如热休克蛋白质70 (heat shock cognate protein of 70 kDa, HSC70) 识别, 并将其运送到溶酶体膜上, 再经溶酶体膜蛋白LAMP-2a结合后被转运到溶酶体腔中被溶酶体酶消化的过程,与大自噬和小自噬相比, CMA的主要特点是细胞质内的蛋白质直接经溶酶体膜蛋白转运入溶酶体腔, 不需形成自噬囊泡。(1)HSC70  70 kDa的热休克同源蛋白, 它是分子伴侣, 在胞浆识别带有KFERQ样序列的CMA底物;(2) LAMP-2a  CMA的速率直接依赖于溶酶体膜上LAMP-2a的含量,LAMP-2a在胞内的水平可由于转录水平改变或降解速率改变而发生变化。抑制LAMP-2a将引起CMA底物GAPDH的聚集; 过表达LAMP-2a, 则引起GAPDH水平下降。 三、 线粒体自噬标志物          线粒体自噬指在ROS、营养缺乏和细胞衰老等内外环境的刺激下, 细胞内的线粒体发生去极化, 而这些被损伤的线粒体将被特异性地包裹进自噬体中并与溶酶体融合, 从而完成 损伤线粒体的降解, 维持细胞内环境稳定 的过程。          流程:损伤的线粒体在发生线粒体自噬之前先发生动力相关蛋白1 (dynamin-related protein 1, DRP1) 介导的 线粒体分裂。线粒体膜电位的下降引起PTEN诱导假定激酶 (phosphatase and tensin homolog-induced putative kinase 1, PINK1) 的聚集, 接着招募E3泛素连接酶Parkin到线粒体。Parkin促进线粒体膜上蛋白质泛素化, p62蛋白与线粒体上泛素化蛋白相互作用, 借助p62与LC3的互作引导线粒体被自噬体包裹[ 24 ]。同时, 线粒体上存在自噬受体如BNIP3 (Bcl-2 and adenovirus E1B 19-kD interacting protein 3) 和NIX/ BNIP3L (BNIP3-like) 也可以与LC3互作使得受损线粒体通过自噬方式被去除。                                                                                                                                                                                                        通常用 线粒体标志物和 自噬标志物 LC3 共定位来显示线粒体自噬。此外, 还有几个线粒体自噬受体也可以考虑用作线粒体自噬的标志。          (1)Atg32是一个分子质量约59 kDa的跨膜蛋白, 定位在线粒体外膜上;         (2)BNIP3和NIX  BNIP3和NIX序列上有56% 的同源度, 且都有BH3结构域, 并与Bcl-2作用。     分子标记:如下图   (ATG5,LC3)         LC3: Atg8/微管相关蛋白1轻链3 (microtubule- associated protein1 light chain 3, LC3) reference:http://html.rhhz.net/YXXB/html/20160106.htm  2.研究方法:一般都是WB 3.研究案例: 本文就从最近师兄推给我的一篇文章,一起学习一下吧。总结一下:本文思路蛮清晰的简单的,动物与细胞表型;通路的探讨;直接作用的证明。其中,直接作用的证明用了模拟方式,没有通过实验。 这样就会想到:验证直接相互作用的方法:蛋白之间-蛋白DNA之间-蛋白RNA之间 相互作用,不管是酵母双杂交、CO-IP、pulldown、ChIP

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Elephantwoman

核糖体,ribosome线粒体,chondriosome溶酶体,cytolysosome中心体,centrosome高尔基体,Golgi's apparatus;Golgi's body;golgiosome内质网,endocytoplasmic reticulum叶绿体,chlorophyll body大液泡,vacuole;vacuolus

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Tracy猪猪

核糖体:Ribose body:线粒体:Line grain of body:溶酶体:Dissolves the enzyme body:中心体:Centrosome:高尔基体:Golgiosome:内质网:Endosarc net:叶绿体:Chloroplast:大液泡:Big 液泡

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