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一、考试科目不同
1、初级审计师：宏观经济学基础、企业财务管理、企业财务会计、法律；审计理论与方法、企业财务审计。
2、初级会计职称：初级资格《初级会计实务》科目考试时长为2小时，《经济法基础》科目考试时长为小时，两个科目连续考试，分别计算考试成绩。
二、报考条件不同
1、初级审计师：取得大学专科学历，从事审计、财经工作满5年；取得大学本科学历，从事审计、财经工作满4年；取得双学士学位或研究生班毕业，从事审计、财经工作满2年。
2、初级会计职称：认真执行《中华人民共和国会计法》和国家统一的会计制度，以及有关财经法律、法规、规章制度，无严重违反财经纪律的行为。
三、成绩查询不同
1、初级审计师：审计师考试成绩在考试后两个半月公布，考生可登录“审计师考试网”或各地“审计师考试网”的“成绩查询”栏目查询考试成绩 。
2、初级会计职称：成绩下发后，当地财政局和人事局会公布办理相关证件时间，按照通知规定的时间去办理即可，是在8月下旬到九月下旬左右。
参考资料来源：百度百科-初级审计师
参考资料来源：百度百科-初级会计职称
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关于初级审计师考试和中级审计师考试的区别如下:
根据对初、中级审计人员知识水平和业务能力的不同要求，两个考试科目各部分内容分为初、中级资格共同考试内容和中级资格单独考试内容。中级审计师考试知识面要比初级更广，题目深度也要大一些。
初、中级审计师均为国家统一组织考试，在每年10月中下旬举行，考试科目及考试题型一致，考试科目为《审计专业相关知识》和《审计理论与实务》，考试范围包括宏观经济学基础、企业财务管理、企业财务会计、法律、审计理论与方法、企业财务审计。均为客观题。考试采用同一套考试大纲。
初级审计师是对于审计专业技术初级（助理审计师）资格和中级（审计师）资格实行全国统一考试制度。考试制度实行后，不再进行相应职务任职资格的评审工作。考试成绩合格者，可获得由国家人事部印制的《专业技术资格证书》，该证书全国范围内有效。
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