法律分析：协议书在本质上也是合同的一种表现形式，只要内容符合法律规定，双方当事人有相应的民事行为能力，协议就有法律效力。如果是在签订合同后，双方又签订补充协议的，则补充协议视为对合同的修改和补充，协议是有效的，如果协议与合同有冲突的，则应以后签的协议为准。
法律依据：《中华人民共和国合同法》第五十二条 有下列情形之一的，合同无效：
（一）一方以欺诈、胁迫的手段订立合同，损害国家利益
（二）恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益
（三）以合法形式掩盖非法目的
（四）损害社会公共利益
（五）违反法律、行政法规的强制性规定。
