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博士毕业后抽检不合格还能修改，修改之后重新答辩，直到答辩合格。《博士硕士学位论文抽检办法》对其有相应的规定：第三条 学位论文抽检每年进行一次，抽检范围为上一学年度授予博士、硕士学位的论文，博士学位论文的抽检比例为10%左右，硕士学位论文的抽检比例为5%左右。第四条 博士学位论文抽检从国家图书馆直接调取学位论文。硕士学位论文的抽取方式，由各省级学位委员会和中国人民解放军学位委员会自行确定。学位论文抽检的相关要求规定：1、论文复评期间暂缓申请答辩，认定为“存在问题”的学位论文不能申请答辩，需按专家意见修改论文，修改后的论文重新提交盲审。2、学校抽检的论文每篇由3名同行专家通讯评议，2名以上（含2名）专家评议意见为“不合格”的，认定为“存在问题”学位论文；1名专家评议意见为“不合格”的，再请2名同行专家复评，前后累计2名以上（含2名）专家评议意见为“不合格”的，认定为“存在问题”学位论文。3、学校抽检的论文采取双盲评议，专家评议结果和意见是论文作者能否进行学位论文答辩的依据之一。抽检论文为研究生信息系统中通过重复率检测和导师、院系审核的学位论文盲审稿。以上内容参考：百度百科-《博士硕士学位论文抽检办法》 
可以修改的，学校的知网查重后还需要专家审论文，专家会对你的论文提出修改意见，最后答辩的时候，答辩的评委老师也可能会让你进行修改。所以，只要保证查重时的论文和提交审核的论文一致就可以了，后面还是可以修改的。
