yangjian_fd
如果你的参考文献格式正确那么系统会自动识别并且剔除不参与正文查重。参考文献标红就说明你的格式有误。系统把你的参考文献当正文来对比查重了。希望可以帮到你,有问题随时追问我吧。 
参考文献一般是不计入查重范围的,被标红了可能是格式有问题,建议对照学校要求进行格式修改。
你只是毕业论文,要求没有学术论文那么高,学术论文主要是因为考虑到知识产权,侵权之类的问题,所以,必须把每一份参考文献都标明,但是,只要在末尾标注了,就可以在正文中不注释,因为,正文中太多的标注,会给人感觉,你这篇学术论文似乎是大染缸,似乎是别人的成果拼凑而成,所以,很多从命的学者,喜欢统一放在论文末了,一来,没有很多人关心,二来,
应该 是格式不正确,知网的算法会根据格式去判别是否属于参考文献的,另外参考考文献的格式尽量不要用工具生成啊