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两者的内容不同:学术论文期刊是在某一学术课题具有的新的科学研究成果或创新见解和知识的科学记录，毕业论文(graduation study)是专科及以上学历教育为对本专业学生集中进行科学研究训练而要求学生在毕业前撰写的论文。两者的主体不同，毕业论文是学生写的，期刊论文是科学研究人员，包括学生写的。两者的时间不同，毕业论文的时间安排在修业的最后一学年(学期)进行，但是学术期刊论文没有限制时间。毕业论文目的在于培养学生的科学研究能力;加强综合运用所学知识、理论和技能解决实际问题的训练 
刊大师：为作者投发学术期刊提供智能化解决方案。会议论文与期刊论文他们之间的区别是什么？！快点进来看看吧！（侵、私、删）
不同专业可能有所不同。我是工科。个人经验，都是比较差的数据才会拿去投会议，因为会议，只要交报名费，肯定是会收的。所以感觉水平第一点。当然会议论文里也有很好的文章。但是如果这个会议没有被杂志收录，将来被检索到的机会就比较小了。你的文章，不就浪费了吗？
这个没有办法比较，需要给出具体的会议及期刊名，比如：你在世界级的www会议上发表一篇English论文A 一般计算机期刊上发表English论文B当然A > B 当然对你所说的，国内对EI收录相当看重，所以我想最好在核实核心期刊以及会议那个会被EI收录。
