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毕业生就业协议和劳动合同都具有法律效益。只不过一个是学校和单位签订的对口实习协议,一个用人单位公司和劳动者直接签的协议。就业协议类似于劳务公司和用人单位之间的协议,属于短期合同,是阶段性的,只包你在该单位实习实践用,完成了学校和用人单位规定的实习期则协议终止,用人单位觉得实习生不错,可以直接与其签订劳动合同成为正式员工。 
就业协议只是双方签订一个就业意向,它没有劳动合同全面的条款那么细,只是民事关系;而劳动合同是双方建立的标准的劳资关系条款,具备与《劳动合同法》有关的法律效力。
法律分析:劳动合同书与就业协议书的区别有:劳动合同书是毕业离校后到单位正式报到后签订,就业协议书是在校期间签订;劳动合同书的主体是劳动者和用人单位,就业协议书的主体是学校、毕业生和用人单位;劳动合同书主要适用《劳动法》、《劳动合同法》,就业协议书主要适用《普通高等学校毕业生就业工作暂行规定》、《民法典》。法律依据:《劳动合同法》第七条 用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系。用人单位应当建立职工名册备查。《普通高等学校毕业生就业工作暂行规定》第十一条全国高等学校毕业生就业工作程序和时间安排由国家教委统一部署,各部委和地方应按照统一部署具体指导所属院校毕业生的就业工作。