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是的。都会查重。论文查重是将论文与检测系统的文献资源进行比较，并通过独特的算法进行计算。论文中的查重率检测非常严格，期刊之间的差异也会影响查重率，期刊类型也是影响查重率的因素。期刊论文主要分为核心期刊、普通期刊⌄核心期刊的重复要求通常高于普通期刊，重复检查标准通常不超过15％，而普通期刊论文的检查标准通常不超过25％。因此，在哪种期刊上发表应明确期刊论文的查重检测规则，以确保我们的论文是准确的。期刊论文查重个人很推荐万方检测，万方检测数据库庞大，和期刊社都有合作，准确率高，平价亲民，知名度也高，支持新论文和已发表论文检测，出具报告全面清晰，方便后续修改。 
论文初稿其实都没有通过导师的审核，是不会上传到论文查重系统上进行查重检测的。学校每次查重检测一篇论文是需要花费不少费用的，论文查重检测系统也并不是都免费进行查重检测的，所以学校是不会随便就把你的论文上传到查重系统进行查重检测的。正常情况下是先提交开题报告，确定开题报告内容没问题后，才开始撰写论文的。论文根据导师的相应要求标准撰写内容，修改调整确定好后，才会提交到论文查重系统中进行查重检测的。所以是无需纠结论文初稿是否会查重检测的。
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