godwithwrb
第一,应确定对方发明专利的有效性,也就是说,是否已经授权,是否处于有效状态;否则不侵权第二,专利侵权是针对以商业目的的产品侵权,你的论文应被认为是商业产品,因此不侵权第三,你提到,“基本上是一样的”,也就是说,不完全一样,因此也不会发生著作权侵权 
一般看论文与其他论文的重复率,另一方面看引用的格式是否正确
归根结底呢查重就是将你提交的文章与数据库当中收录的文章进行一个比对,最主要的影响因素就是你文章内容的来源,如果你的文章原创度是很高的话那么查重结果一般都不会高到哪里去的,反之如果是借鉴了许多其他人的成品那么优秀的文章一般都会被收录,所以这个查重结果一般都是比较高的。