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不算，若用户引用参考文献的格式设置正确，查重系统不会计算参考文献的重复率，而是计算参考文献的引用率是多少。查重系统在对参考文献查重时，会先识别参考文献的引用格式，若格式正确，查重系统会将参考文献的内容和引用库的内容进行比对，如果内容一致，查重系统就会判断这部分内容为参考文献部分。在写论文过程中引证文献是在正常不过的事情了，在写作之前要阅览很多的文献，了解行业界学科发展的状况，这本身也是常识积累和学习的一个过程，因此，只要作者在写论文的时候，用正确的引用格式，且引用的部分不是很大就不会有影响，知网论文查重会自动识别为引用部分，以绿色字体标注。但是一定要注意的是，引用过程中绝对不能大片的引用，因为也会被检测为抄袭。 
现在我国各大高校都在不断加大禁止个人抄袭的力度。现在大学对论文重复率的规定越来越严格。所以同学们对于会影响论文重复率的要素都要分外在意，有一个问题同学们都异常关注，那就是论文参考文献是不是在论文检测的范畴之内呢？为什么每年同学们都会出现这样的问题呢？你提交的论文和数据库里面的论文对比，如果发现有重复性的部分，那么重复性的内容就会被打上红色的标记。你会发现，你的参考文献也是红的，参考文献确实都是相似的内容，最早有同学问我，我对用户的回应都是毋庸置疑的，学术不端检测其实不包含论文参考文献。学术不端检测并非可以筛选出所有的论文参考文献，只有符合格式的论文参考文献才会被学术不端筛选出来，这也就代表了只有当参考文献格式规范得当的时候，学术不端才能在检测层面上剔除掉这部分论文参考文献。所以总结一下论文参考文献为何会在学术不端检测报告中标红呢？一是毕业论文创作者使用不正规的学术不端检测软件开展论文检测，而此类学术不端检测软件优化算法并不健全，无法对论文参考文献进行甄别，导致论文参考文献被标注为红色；二是毕业论文的参考文献格式错误，导致学术不端检测软件无法对该部分论文参考文献进行甄别，将其作为论文的内容处理，如果参考格式适当，就会被学术不端检测筛选。三是学生毕业设计论文的目录数据格式有误，造成了第二点差不多的问题，所以也会飘红。
