医学信息学于1950年代伴随微芯片和计算机的增长在美国产生医学信息学早期的名字包括: 医学计算学， 医学计算机科学;计算机医学，医学电子数据处理;医学数据自动化处理;医学信息处理，医学信息科学，医学软件工程和医学计算机技术从1980年代开始， 都等同加入国际医学信息学协会(IMIA)将计算机科学与医学结合的研究最早始于1950年代，Rober Ledley参与的美国国家标准局的口腔医学项目；1950年中期，MYCIN和INTERNEST-I专家系统被开发出来；1965年开发了马萨诸塞州总医院通用多程序系统（MUMPS）；1994年，香港医院管理局开发了临床管理系统（CMS）计算机化病历系统1996美国大量外科医生转向应用电子病历软件，在一定程度上保证医疗账单安全；2002年，Australian College of Health Informatics (ACHI)成立，其旨在提高国家在医学信息学研究，教育和培训以及政策制定和系统实现等方面的能力；在英国，旨在进行医学信息学登记和调控的UK Council for Health Informatics Professions (UKCHIP)信息系统已经展开。
