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参考文献标红主要是格式不正确导致的,你可以自己核对冰校准格式之后再提交检测,一般查重系统不会对参考文献进行标红的,标红了说明参考文献并没有被识别出来 
以知网查重系统的报告为例,报告中标黑的文字是没有重复的,有抄袭重复的标红,引用重复的文字标绿。假如文字的重复率比较高,那么就需要针对重复的文字也就是标红和标绿的文字进行改动和调整,以达到减少重复的目的。一般来说标黑的文字是不用修改的,如果对黑色的文字疑似是复制有重复的,也可以进行一下修改的,以保证总重复率可以有效降低下来的。
有时自己的写的也会与学术数据库数据相似,最重要的是要看检测出的标红处与来源出处是否有相似之处,是否合理。