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第一个区别:发表的载体不同!一个是发表在期刊上,一个是发表在会议论文集上!第二个区别:期刊论文一般不用去开会交流,而发表在会议上的论文一般要求去参加会议进行学术交流!如果您对这个回答满意, 请点击回答内容右下方的“…”,再点击“采纳”。多谢了! 
参加国家级学术会议并发表了会议论文,严格地说,只能算是宣读了论文。一般宣读后的论文都会结集出版或在期刊上发表,只有在核心期刊发表才能算。
如果核心期刊是一般的科技核心,或者行业核心,这种和普刊基本没差别,EI会议论文虽然是会议级别,但是毕竟是EI级别,很多单位能够发EI级别的文章,都有丰厚的奖励的,如果不知道如何发表EI会议论文,可度娘下:EI会议中心,有很多发表技巧和方法
在很多省,论文集文章评正高都有效,按常规,出版社出版的成果比报刊更有效力。